潔凈棚是通過采取密閉的結構，合理的空氣處理方法，合理的氣流組織及合理的壓差，才能使其微環境達到所要求的空氣潔凈度，來符合生產要求。
其通過采取密閉的結構，合理的空氣處理方法，合理的氣流組織及合理的壓差，才能使其微環境達到所要求的空氣潔凈度，來符合生產要求。
控制空氣潔凈的辦法一種是送入潔凈空氣對室內污染空氣進行稀釋，另外一種是加速排出室內濃度高的污染空氣。為保持生產環境所要求的空氣潔凈度，需要采取多方面的綜合措施才能符合目標。這些綜合措施包括以下幾個方面。
一、控制污染源，減少污染
盡量采用產生污染物質少的工藝及設備，不讓生產工藝產生的污染物向周圍擴散；減少人員及物料帶入室內的污染物質。
二、阻止室外的污染侵入室內
這是潔凈棚污染控制的主要途徑，要考慮空氣潔凈處理的方法、室內的壓力控制等。根據房間不同的潔凈度要求，用不同方式送入經過不同處理的、數量不等的清潔空氣，同時排走室內產生的臟空氣，使室內空氣維持在要求的潔凈度水平。
由此可見，對送入空氣的潔凈處理是很關鍵的環節，這也是潔凈室換氣次數大于一般空調房間的原因。潔凈度越小，其換氣次數越多，對于室內正壓的控制，工業潔凈室和一般生物潔凈室采用正壓措施。
三、清理室內已經發生的污染
這也是體現
潔凈棚功能的關鍵。合理的氣流組織，即通過送風口及回風口位置、大小、形式的精心設計，使室內氣體沿相應方向流動，以免死角及造成二次污染。不同的氣流組織均直接影響施工的難度及工程造價。
四、流速控制
棚內空氣的流動既要有速度，才能不讓其他因素（如熱流）的擾亂，但又不能太大，流速太大將使室內積塵飛揚，造成污染。
五、系統的氣密性
不但通風系統本身要求氣密性好，對建筑各部分結合處、水暖電工藝管道穿越圍護結構處亦應堵嚴，以免滲漏。一般看得見的縫隙、裂縫均無法阻止0.5um粒徑的粉塵通過。
